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        KEGG 怎么用?

        來源:千鋒教育
        發(fā)布人:xqq
        時間: 2023-10-13 03:13:12 1697137992

        一、KEGG的用法

        KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一個廣泛使用的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫,提供了關(guān)于基因、代謝通路、疾病等生物信息的豐富資源。

        1、訪問KEGG網(wǎng)站

        打開KEGG的網(wǎng)站

        2、數(shù)據(jù)查詢

        基因查詢:在網(wǎng)站的搜索框中輸入基因名、基因ID或其他相關(guān)信息,點擊”Search”進行基因的搜索。KEGG提供了豐富的基因相關(guān)信息,如基因功能、通路關(guān)聯(lián)等。通路查詢:在網(wǎng)站的搜索框中輸入通路名或通路ID,點擊”Search”進行通路的搜索。KEGG提供了詳細的代謝通路和信號傳導(dǎo)通路信息,包括圖形展示和相關(guān)基因、化合物的關(guān)聯(lián)。

        3、數(shù)據(jù)瀏覽

        瀏覽查詢結(jié)果,查看基因、通路或其他相關(guān)信息的詳細頁面。KEGG提供了圖形展示、注釋、參考文獻等相關(guān)信息,以及與其他數(shù)據(jù)庫的鏈接。

        4、數(shù)據(jù)分析

        根據(jù)需要,可以進一步分析和解釋KEGG提供的數(shù)據(jù)。例如,可以將查詢的基因列表導(dǎo)入到生物信息學(xué)工具中進行富集分析、通路分析等。

        5、API訪問

        KEGG還提供了API(Application Programming Interface),可以通過API訪問KEGG的數(shù)據(jù)和功能。開發(fā)人員可以使用API來獲取特定數(shù)據(jù)、進行數(shù)據(jù)集成和自動化分析等。

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